FlexCMP integra un motore di ricerca interno accessibile, che fornisce risposte in liguaggio naturale (declinato per lingua in eventuali siti multi lingua).
Lo spider interno indicizza non solo le pagine ma anche eventuali documenti in formato PDF o RTF in esse inseriti.
E' possibile ricercare parole chiave presenti nelle pagine oppure all'interno dei documenti allegati (PDF e RTF).
Il motore di ricerca dispone anche di funzionalità di ricerca avanzata per la limitazione delle ricerche a singoli argomenti o sezioni del sito.
Nell'ambito del progetto editoriale e dell'impostazione del sito è possibile inserire box di ricerca specifici limitati ai contenuti della sezione corrente.
E' sempre possibile inserire anche motori specifici destinati ad effettuare ricerche in database o file XML esterni.